En ese entonces, el equipo victoriano se limitaba a pasearse los domingos por los distritos y provincias de Lima en busca de partidos, bajo el sobrenombre Íntimos de La Victoria.12 Luego de un pacto entre la Federación Peruana de Fútbol y Alianza Lima, se les levantó el castigo impuesto para que puedan jugar frente al cuadro argentino, con la condición que aportasen jugadores el domingo siguiente para la selección peruana, que debía jugar el Sudamericano de Argentina. Al ganar dicho encuentro Universitario fue declarado campeón de 1934. Esto último creó con el tiempo una confusión en los medios que comenzaron a considerar campeón de aquel año al Universitario, confusión que alcanzó publicaciones auspiciadas por los entes rectores del fútbol peruano, a pesar que los boletines informativos de aquella época los cuales fueron publicados en los diarios, dan como campeón absoluto de 1934 a Alianza Lima, sin embargó los boletines oficiales de la Liga fueron destruidos en los años 90s por lo que no se puede corroborar dicha información. En ese partido formaron jugadores como Eugenio Segalá, José Pavón, Alberto Soria, Filomeno García, Julio Quintana, Domingo García, José María Lavalle, Juan Bulnes, Guillermo Rivero, Alberto Montellanos y Jorge Koochoi Sarmiento.18 El partido se llevó a cabo en una de las canchas del Circolo Sportivo Italiano, el cual dejó como saldo un triunfo para el equipo peruano, el primero a nivel internacional, con el resultado de 3:2.12 En 1927 tuvo lugar su primer enfrentamiento con la Federación Universitaria, que posteriormente cambió su nombre a Universitario de Deportes; equipo que con el tiempo se convirtió en su rival por antonomasia en el fútbol peruano.

A mediados y finales de los años 1920, Alianza fue invitado a una gira a Costa Rica, financiada por los clubes Libertad y Herediano.19 El elenco aliancista llegó a tierra costarricense a finales del diciembre de 1927. El 1 de enero de 1928 se jugó el primer partido contra Herediano en el Estadio Nacional de San José.20 El encuentro terminó con la victoria del cuadro costarricense por 4:3.19 El 8 de enero se enfrentó a Libertad, donde en aquella oportunidad ganaron los blanquiazules por 0:2.20 En el transcurso de la semana, Alianza recibió un homenaje a su llegada a Santo Domingo de Heredia, donde derrotó a un combinado local por 2:3.20 El 15 de enero, Alianza tuvo la oportunidad de cobrarse la revancha frente a Herediano, ya que los aliancistas golearon por 1:4.19 Ante el triunfo del equipo blanquiazul, la afición de Costa Rica esperaba una victoria de Libertad, el próximo rival del equipo peruano. Uno de los aportes más importantes que hizo Alianza al combinado nacional fueron con motivo de las Olimpiadas de Berlín 1936, donde fueron convocados Juan Valdivieso, Víctor Lavalle y como delanteros Adelfo Magallanes Campos, Alejandro Villanueva, José Morales y Eulogio García. El único título nacional que obtuvo Alianza Lima en los años 1940 fue el de la temporada 1948. Aquel equipo que se coronó campeón fue dirigido por un ex-jugador blanquiazul, Adelfo Magallanes.

A pesar del subcampeonato de 1953, al año siguiente consiguieron el título de 1954 para después volverse a coronar bicampeones en 1955. Cabe destacar la final disputada entre los clásicos rivales Alianza Lima y Universitario, donde los dos pelearon por el título de aquella temporada en un partido definitorio, el cual ganaron los blanquiazules. El estadio se conocerá oficialmente como Emirates Stadium hasta al menos 2028, y la aerolínea será el patrocinador de la camiseta del club hasta al menos 2024. Desde el comienzo de la temporada 2010-11 en adelante, las gradas del estadio se conocen oficialmente como North Bank, East Stand, West Stand y Clock end. El club había tenido más jugadores muertos que cualquier otro club de la máxima categoría, y la deuda de la reconstrucción de North Bank Stand desangró los recursos del Arsenal. Con jugadores clave de la tierra natal de Wenger, como Patrick Vieira y Thierry Henry, el Arsenal ganó un segundo doblete de Liga y Copa en 1997-98 y un tercero en 2001-02. Además, el club alcanzó la final de la Copa de la UEFA 1999-2000, ganó las Copas FA de 2003 y 2005 y ganó la Premier League en 2003-04 sin perder un solo partido, un logro que le valió al equipo el apodo «. Los invencibles».

Dicho campeonato ha resultado polémico ya que la tabla de posiciones final sumaba los puntos del torneo de primeros equipos y 1/4 de los puntos del torneo de reservas en la clasificación general. Al quedar empatado el torneo de primeros equipos, el torneo de reservas le dió al Alianza Lima la ventaja final en la clasificación general por 0.25 puntos, después de la última fecha en la cual Alianza ganó al Universitario los partidos en ambas categorías. Al quedar empatado el torneo de primeros equipos, la liga determino un desempate jugado a mediados del año siguiente. La alegría de los logros de la primera mitad de la década del 30 desapareció en el año 1938, luego de un campeonato deficiente, Alianza Lima ocupa el penúltimo lugar de la Liga Peruana tras perder 0:2 ante el Sucre y descendió a Segunda División.26 . En 1962, con jugadores como Rodolfo Bazán, Adolfo Donayre, Wantuil da Trinidade, Juan de la Vega, Rivas, Rodolfo Guzmán, Víctor Zegarra, Pedro Pablo León y Víctor Rostaing lograron otro campeonato más.33 La incorporación del zaguero Wantuil da Trinidade, significó romper la tradición de jugar sólo con futbolistas peruanos en el profesionalismo. La década del 60 significó la presencia de dos jugadores relevantes en su historia como lo fueron Víctor Zegarra, jugador de un toque destacable y habilidoso con el balón en los pies; y Pedro Pablo León, quien pasó parte de su niñez en Alianza y fue testigo de los logros conseguidos en años anteriores.